一是依法治税工作落后。农业税收存在“重收入、轻管理”的现象,税收征管行为有待进一步规范；加之现行农业税收制度不够健全，制约了依法治税工作的开展。
二是依法纳税意识淡薄。农业税收政策普及、教育力度不大，农民群众依法主动纳税意识不强；抗、欠税和行政干预税收征管及擅自减免税现象时有发生。
三是繁重的工作任务与薄弱的征管力量之间的矛盾日益突出。税改后，对农业税收征管的要求越来越高，而目前全市每县平均只有3─4名征管人员，乡镇只有1─2名专职农税专管员，且乡镇绝大多数征管机构不具备执法主体资格。造成税收政策执行不到位，群众上访，影响了征收，影响了稳定。
四是征管手段落后。全市数百万份纳税通知书、完税凭证、减免税手续全为手工操作，远不适应现代农业税收征管的需要。